脂多糖调控对大鼠心脏微血管内皮细胞的转录组分析

《中华细胞与干细胞杂志(电子版)》[ISSN:2095-1221/CN:11-9310/R] 期数: 2020年第10卷第6期 栏目: 论著

作者:岳影星,杨舟鑫,卢艳,等

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页码:328

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【摘要】 目的 探索脂多糖 (LPS)对大鼠心脏微血管内皮细胞 (rCMECs)转录组的调节作用。方法 对照组 (正常培养rCMECs),LPS组 (100 ng/mL LPS处理6 h的rCMECs),每组进行3个生物学重复转录组测序。得到差异基因后,使用实时定量PCR对部分差异基因mRNA的表达进行验证。分别对上调和下调基因进行GO和KEGG富集,并对差异基因进行共表达网络分析。采用独立t检验进行统计学分析。结果 LPS处理后,265个基因表达上调,118个基因的表达下调。前10个最显著上调基因为:Mt2a、Cyp7b1、Sod2、Icam1、Ccl2、AC128848.1、Mt1、Cebpd、Serpinb2和Tnfrsf11b。前10个最显著下调基因为:Cavin2、Ankrd1、Edn1、Prss35、Lmod1、Dhrs3、Ttc22、Sema6a、Map2k3和Sema7a。定量PCR的结果表明Mt2a、Sod、Ccl2、Cxcl1、Icam1和Vcaml基因的表达得到了上调 (P均 < 0.01);而Cavin2、Ankrd1、Edn1和Prss35基因表达下调 (P均 < 0.05)。GO和KEGG富集的结果表明,上调基因与内皮细胞对炎性免疫细胞的趋化作用和黏附作用密切相关;而下调基因则是与钙离子信号和G蛋白相关通路以及内皮通透性增加有关。此外,差异基因进行共表达网络分析发现Sod2处于核心位置,提示其可能与LPS诱导的rCMECs的各种变化密切相关。结论 LPS调控了rCMECs中大量与炎性免疫细胞进入心肌组织相关基因的表达。
【关键词】 脂多糖; 大鼠; 心脏微血管内皮细胞; 内皮功能; 转录组

 

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